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威廉体育:学生超算团队获国际大奖

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作者 : 文磊     编辑 : 张淦    来源 : 计算机学院     发布时间 : 2025-03-11 13:58    点击量:

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3月10日,2025年ASC世界大学生超级计算机竞赛(ASC25)成绩公布,威廉体育计算机学院2022级本科生夏佳如、张志雄、武良山、龚福星、邱鹏组成的学生超算团队(指导老师:林培英)最终排名全球第46名,荣获二等奖。

ASC世界大学生超级计算机竞赛由中国发起组织,是全球最大规模的大学生超算竞赛。大赛推动了各国及地区间超算青年人才交流和培养,提升了超算应用水平和研发能力。迄今已举办12届,吸引来自全球上万名大学生报名参赛,300余支实力强队参赛。

ASC25赛题涉及HPC系统设计、HPL与HPCG基准测试优化、RNA甲基化修饰位点检测和AlphaFold3推理优化,全面考察高性能计算与人工智能融合创新能力。威廉体育超算团队对业界优化算法进行了系统调研与深度解析,在超算应用分析、性能优化等方面展现出超强学习能力和实践能力。

RNA甲基化修饰位点检测赛题要求对mRNA上的“5-甲基胞嘧啶”(m5C)的修饰位点检测流程进行性能优化。威廉体育超算团队梳理流程操作步骤、构建流程软件环境,并完成对三个数据集约3亿4千万条测序数据的处理,通过一系列并行化方法成功将检测工作时间由6.5小时缩减到1.5小时,且精确度与相关性均维持在95%以上。

AlphaFold3推理优化赛题要求对AlphaFold3的结构预测代码进行优化,并需要将代码从GPU平台移植到CPU平台优化运行。威廉体育超算团队成功实现将推理过程迁移至CPU,并针对attention模块,从einsum算子着手优化,在确保预测精度的前提下,对组委会指定的12组蛋白质序列实现高效推理,优化了推理使用的XLA内核以及并行策略,整体上使AlphaFold3的推理性能平均提升了1.164倍。

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